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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
Data corrente: |
03/11/2022 |
Data da última atualização: |
12/12/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
KAUFFMANN, C. M.; BOARI, A. de J.; SILVA, J. M. F.; BLAWID, R.; NAGATA, T. |
Afiliação: |
CATERYNNE MELO KAUFFMANN, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; ALESSANDRA DE JESUS BOARI, CPATU; JOÃO MARCOS FAGUNDES SILVA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; ROSANA BLAWID, UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DE PERNAMBUCO; TATSUYA NAGATA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA. |
Título: |
Complete genome sequence of patchouli chlorosis-associated cytorhabdovirus, a new cytorhabdovirus infecting patchouli plants in Brazil. |
Ano de publicação: |
2022 |
Fonte/Imprenta: |
Archives of Virology, v. 167, n. 12, p. 2817-2820, 2022. |
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00705-022-05594-5 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
A cytorhabdovirus, tentatively named "patchouli chlorosis-associated cytorhabdovirus" (PCaCV), was identified in a patchouli plant, using high-throughput sequencing, and its genome sequence was confirmed by Sanger sequencing. The PCaCV genome consists of 12,913 nucleotides and contains six open reading frames in the order 3'-N-P'-P-P3-M-(G)-L-5'. The glycoprotein gene was found to contain stop codons in the coding frame; hence, this gene is considered defective. PCaCV is most closely related to tomato yellow mottle-associated virus, sharing 61.1% nucleotide sequence identity in the complete genome and 73.9% amino acid sequence identity in the L protein. These data suggest that PCaCV should be considered a new member of the genus Cytorhabdovirus, and the binomial species name "Cytorhabdovirus patchoulii" is proposed. |
Palavras-Chave: |
Patchouli. |
Thesagro: |
Genoma; Vírus. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 01523naa a2200217 a 4500 001 2147984 005 2022-12-12 008 2022 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s00705-022-05594-5$2DOI 100 1 $aKAUFFMANN, C. M. 245 $aComplete genome sequence of patchouli chlorosis-associated cytorhabdovirus, a new cytorhabdovirus infecting patchouli plants in Brazil.$h[electronic resource] 260 $c2022 520 $aA cytorhabdovirus, tentatively named "patchouli chlorosis-associated cytorhabdovirus" (PCaCV), was identified in a patchouli plant, using high-throughput sequencing, and its genome sequence was confirmed by Sanger sequencing. The PCaCV genome consists of 12,913 nucleotides and contains six open reading frames in the order 3'-N-P'-P-P3-M-(G)-L-5'. The glycoprotein gene was found to contain stop codons in the coding frame; hence, this gene is considered defective. PCaCV is most closely related to tomato yellow mottle-associated virus, sharing 61.1% nucleotide sequence identity in the complete genome and 73.9% amino acid sequence identity in the L protein. These data suggest that PCaCV should be considered a new member of the genus Cytorhabdovirus, and the binomial species name "Cytorhabdovirus patchoulii" is proposed. 650 $aGenoma 650 $aVírus 653 $aPatchouli 700 1 $aBOARI, A. de J. 700 1 $aSILVA, J. M. F. 700 1 $aBLAWID, R. 700 1 $aNAGATA, T. 773 $tArchives of Virology$gv. 167, n. 12, p. 2817-2820, 2022.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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Volume |
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Registros recuperados : 21 | |
2. | | QUADROS, A. F. F.; KAUFFMANN, C. M.; BOARI, A. de J.; BLAWID, R.; NAGATA, T. Sequenciamento do genoma de um Cytorhabdovirus infectando patchouli. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 51., 2019, Recife. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2019. p. 836.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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3. | | KAUFFMANN, C. M.; BOARI, A. de J.; SILVA, J. M. F.; BLAWID, R.; NAGATA, T. Complete genome sequence of mimosa mosaic virus, a new sobemovirus infecting Mimosa sensitiva L. Archives of Virology, v. 168, n. 1, Article number 28, Jan. 2023.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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4. | | KAUFFMANN, C. M.; BOARI, A. de J.; SILVA, J. M. F.; BLAWID, R.; NAGATA, T. Complete genome sequence of patchouli chlorosis-associated cytorhabdovirus, a new cytorhabdovirus infecting patchouli plants in Brazil. Archives of Virology, v. 167, n. 12, p. 2817-2820, 2022.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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7. | | KAUFFMANN, C. M.; BOARI, A. de J.; KITAJIMA, E. W.; BLAWID, R.; NAGATA, R. Detecção de uma nova espécie de Fabavirus em pimenteira-do-reino por sequenciamento de alto desempenho. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 51., 2019, Recife. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2019. p. 814.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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10. | | KAUFFMANN, C. M.; CORDOVIL, G. D'A.; BOARI, A. de J.; GOMES JUNIOR, R. A.; FREIRE FILHO, F. R. Reação de genótipos de feijão-caupi tipo manteiguinha ao Cowpea severe mosaic virus. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 23., 2019, Belém, PA. Anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2019. p. 259-262.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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12. | | KAUFFMANN, C. M.; CORDOVIL, G. D'A.; PANTOJA, K. de F. C.; GAVINHO, B. E. S.; BOARI, A. de J. Detecção de um Fabavirus em matrizeiros de pimenteira-do-reino. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 23., 2019, Belém, PA. Anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2019. p. 263-266.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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13. | | KAUFFMANN, C. M.; BOARI, A. de J.; SILVA, J. M. F.; BLAWID, R.; KITAJIMA, E. W.; NAGATA, T. Detection, characterization, and occurrence of black pepper virus F in black pepper plants in Brazil. Tropical Plant Pathology, v. 48, n. 3, p. 347-351, 2023.Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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16. | | SILVA, B. A.; KAUFFMANN, C. M.; MOTA, H. B. S.; QUEIROZ, P. S.; BATISTA, A. M. V.; CARDENAS, S. B. S.; FREITAS, D. M. S.; NAGATA, T. First report of Moroccan watermelon mosaic virus in pumpkin plants in Brazil. Plant Disease, V. 108, N. 2, P. 513, 2024.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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17. | | QUADROS, A. F. F.; BOARI, A. de J.; KAUFFMANN, C. M.; FREIRE FILHO, F. R.; BATISTA, I. C. A.; GAVINHO, B. E. S.; NECHET, K. de L. First report of Rhizoctonia solani AG1-IA infecting yard-long bean. Australasian Plant Disease Notes, v. 16, n. 1, article 21, 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Meio Ambiente. |
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18. | | BOARI, A. de J.; CORDOVIL, G. A.; KAUFFMANN, C. M.; GAVINHO, B. E. S.; QUADROS, A. F. F.; PANTOJA, K. F. C.; GOMES JUNIOR, R. A.; FREIRE FILHO, F. R.; OLIVEIRA, R. P. de; KITAJIMA, E. W. Bean common mosaic virus infecting manteiguinha cowpea (Vigna unguiculata): seed transmission, evaluation of yield loss, and genetic resistance. Tropical Plant Pathology, v. 47, n. 3, p. 450-455, June 2022.Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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19. | | MAEDA, M. H. K.; KOYAMA, L. H. H.; CAMPOS, R. N. S.; KAUFFMANN, C. M.; SOUZA, J. O. de; GILBERTSON, R.; INOUE-NAGATA, A. K.; FREITAS, D. M. S.; NOGUEIRA, D. R. S.; MELO, F. L.; NAGATA, T. First report of watermelon crinkle leaf-associated virus 1 and 2 infecting watermelon (Citrullus lanatus) plants in Brazil. Plant Disease, v. 106, n. 2, p. 773, Feb. 2022.Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças; Embrapa Semiárido. |
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20. | | SILVA, B. A.; MOTA, H. B. da S.; KAUFFMANN, C. M.; QUEIROZ, P. de S.; BATISTA, A. M. do V.; CÁRDENAS, S. B. dos S.; FREITAS, D. M. S.; NAGATA, T. Identificação de vírus associados a cucurbitáceas por sequenciamento de alto desempenho. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 53., 2023, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2023. p. 649.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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